課程資訊
課程名稱
基因體研究論著選讀
Genomic Study Seminar 
開課學期
106-2 
授課對象
醫學院  生理學研究所  
授課教師
賴亮全 
課號
Physio7017 
課程識別碼
441 M3400 
班次
 
學分
2.0 
全/半年
半年 
必/選修
選修 
上課時間
星期二7,8(14:20~16:20) 
上課地點
基醫1003 
備註
本課程中文授課,使用英文教科書。
總人數上限:25人
外系人數限制:10人 
Ceiba 課程網頁
http://ceiba.ntu.edu.tw/1062Physio7017_ 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

本課程內容如下:
*Introduction: brief history of genetics
*Comparative Gene-Expression Analysis I: Hybridization-based techniques
-- In-house spotted arrays
-- Prespotted array (inkjet print)
-- Photolithograph
-- Maskless array synthesis
-- BeadChip
-- MicroArray Quality Control (MAQC) Project

*Comparative Gene-Expression Analysis II: PCR-based techniques
-- RT-PCR
-- Digital PCR

*Comparative Gene-Expression Analysis III: Sequence-based techniques
-- Next generation sequencing

*Genomic approaches to study:
-- Gene expression profiling
-- Single nucleotide polymorphism (SNP), copy number variation (CNV), loss of heterozygosity (LOH)
-- DNA-protein interaction
-- Epigenomic: DNA Methylation
-- Epigenomic: noncoding RNA
-- Metagenomics 

課程目標
本課程主旨在教導同學瞭解基因體技術在生物學上的應用及最新發展趨勢。 
課程要求
不遲到早退, 積極參與課堂間的報告與討論 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
另約時間 
指定閱讀
 
參考書目
無 
評量方式
(僅供參考)
 
No.
項目
百分比
說明
1. 
期中考 
40% 
 
2. 
期末口頭報告 
25% 
 
3. 
期末書面報告 
25% 
 
4. 
出席 
10% 
 
 
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
2/27  Introduction: brief history of genetics/Human Genome Project 
第2週
3/06  Comparative Gene-Expression Analysis I: Hybridization-based techniques 
第3週
3/13  Comparative Gene-Expression Analysis I: Hybridization-based techniques 
第4週
3/20  Comparative Gene-Expression Analysis I: Hybridization-based techniques 
第5週
3/27  Comparative Gene-Expression Analysis II: PCR-based techniques 
第6週
4/03  Spring break 
第7週
4/10  Comparative Gene-Expression Analysis III: Sequence-based techniques 
第8週
4/17  Mid-term Examination 
第9週
4/24  Comparative Gene-Expression Analysis III: Sequence-based techniques 
第10週
5/01  Genomic approaches to study gene expression 
第11週
5/08  Genomic approaches to study chromosomal aberration 
第12週
5/15  Genomic approaches to study DNA Methylation 
第13週
5/22  Genomic approaches to study non-coding RNA 
第14週
5/29  Genomic approaches to study non-coding RNA 
第15週
6/05  Genomic approaches to study DNA-protein interaction / metagenomics 
第16週
6/12  Final Project Presentation 
第17週
6/19  Final Project Presentation